2013年3月，国务院核定公布第七批全国重点文物保护单位，济宁市入选17处。至此，我市共拥有全国重点文物保护单位5大类共36处。其中，古遗址8处，古墓葬6处，古建筑19处，石刻2处，近现代重要史迹及代表性建筑1处。济宁市国保单位分布情况为：曲阜市11处，邹城市7处，兖州市5处，市直3处，嘉祥县3处，汶上县2处，市中区1处，泗水县1处，微山县1处，金乡县1处，梁山县1处。

1961年3月，我市4处文物点入选第一批全国重点文物保护单位。包括曲阜鲁国故城、孔庙及孔府、孔林、嘉祥武氏墓群石刻。

1988年1月，我市3处文物点入选第三批全国重点文物保护单位。包括崇觉寺铁塔、邹城孟庙孟府孟林、铁山岗山摩崖石刻。

2001年6月，我市2处文保单位入选第五批全国重点文物保护单位。包括曲阜、邹城汉鲁王墓和邹城颜庙。

2006年5月，我市10处文保单位入选第六批全国重点文物保护单位。分别是邾国故城、王因遗址、贾柏遗址等3处遗址，萧王庄墓群、明鲁王墓等2处古墓葬，泗水卞桥、济宁东大寺、尼山孔庙及书院、嘉祥曾庙、京杭大运河等5处古建筑。另外，将孟林、葛山峄山摩崖石刻分别与第三批全国重点文物保护单位中的孟庙孟府孟林、铁山岗山摩崖石刻合并。

2013年3月，我市17处文保单位入选第七批全国重点文物保护单位。分别是野店遗址、青堌堆遗址、西夏侯遗址、西吴寺遗址等4处古遗址，防山墓群、孟母林墓群等2处古墓葬，金口坝、重兴塔、太子灵踪塔、兴隆塔、伏羲庙光善寺塔、周公庙、慈孝兼完坊、青山寺等9处古建筑、景灵宫碑等1处石刻，兖州天主教堂等1处近现代重要史迹及代表性建筑。